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MLPA檢測原理

更新時間:2025-12-18點擊次數:54

一、MLPA核心原理一句話概括

MLPA通過設計一對特殊的、靶向相鄰DNA序列的探針,只有當這對探針同時與靶序列wanmei結合時,才能連接成一個完整的模板,隨后被通用引物擴增并定量。擴增產物的量直接反映了靶序列的拷貝數。

二、 MLPA檢測原理分步詳解

image.png 

下面,我們來詳細解讀流程中的每一個關鍵步驟:

 1步:探針雜交

   一對探針:針對每一個待檢測的靶位點,都設計有兩條非常短的寡核苷酸探針。

       左探針:包含一段靶序列特異性雜交序列 + 一段通用的引物結合"序列X。

       右探針:包含一段靶序列特異性雜交序列 + 一段長度不等的填充序列" + 一段通用的引物結合"序列Y

   特異性結合:將這一對探針與變性后的樣本DNA混合。它們會尋找并精確地雜交到目標DNA上相鄰的位置(通常只間隔1個核苷酸)。

 2步:連接反應(最關鍵的一步)

   連接依賴"的核心:只有當左、右探針都wanmei地與靶DNA結合并緊密相鄰時,連接酶才能將它們共價連接成一條完整的、長的DNA模板。

   嚴苛的質控:如果靶序列缺失(拷貝數為0)或發生點突變導致探針無法結合,連接反應就不會發生。這確保了后續信號的特異性,避免了假陽性。

 3步:PCR擴增

   通用引物擴增:使用一對針對所有連接產物上通用序列XY的引物進行PCR擴增。

   產物長度各異:由于每個右探針的填充序列"長度不同,因此每個靶位點對應的最終PCR產物都具有獨特的長度(就像不同大小的條形碼")。

 4步:毛細管電泳分離與定量

   按長度分離:將所有PCR產物進行毛細管電泳,嚴格按照片段長度進行分離。

   熒光檢測:PCR引物或探針上標記有熒光基團,因此每個長度的片段會產生一個熒光信號峰。

 5步:數據分析

   峰高/面積 = 相對拷貝數:通過軟件分析每個峰的高度或面積。將其與同一反應中多個內參基因(已知為二倍體,拷貝數穩定)的峰進行比較。

   結果解讀:

       正??截悢担?/span>2份):靶位點峰高與內參峰高比值約為1.0。

       缺失(1份或0份):比值約為0.50。

       重復/擴增(3份或以上):比值約為1.5或更高。

三、 MLPA原理的獨特優勢

1.  高通量:單次反應可輕松檢測40-50個不同的靶位點。

2.  高特異性與準確性:依賴雙探針wanmei結合"的連接步驟,如同雙重校驗,極大減少了非特異性擴增。

3.  DNA質量要求低:因為探針很短(~50-70 nt),即使DNA部分降解(如FFPE樣本),也能有效雜交和連接,而長片段PCR則會失敗。

4.  可檢測甲基化(MS-MLPA):通過對右探針的雜交序列進行HhaI酶切位點設計。如果靶序列被甲基化,酶切被阻止,探針可連接擴增;如果未甲基化,酶切斷開探針,無法擴增。通過比較酶切處理與未處理的信號,即可判斷甲基化狀態。

四、與其他技術的核心區別

特性

MLPA

定量PCR

微陣列比較基因組雜交

原理基礎

連接依賴的探針擴增

引物延伸擴增

芯片上的競爭性雜交

通量

中等(多重)

低(通常單重或少量多重)

高(全基因組)

檢測目標

已知靶點的CNV/甲基化

已知單靶點CNV/表達

未知/全基因組CNV

DNA需求/質量

低,耐受降解

很低

高,需要高質量DNA

 

總結來說,MLPA的原理精髓在于其連接依賴"長度編碼"的設計,使其成為檢測已知基因拷貝數變異和甲基化的一種高度多重、精準且經濟高效的技術,特別適用于臨床診斷和大規模篩查。


MLPA技術專家——MRC HOLLAND代理---天津益元利康生物科技有限公司,歡迎咨詢選購。

益元利康有限公司是一家專注于生命科學實驗室快速消耗品為主營方向的生命科技企業,提供完整的產品和服務體系,為廣大的科研用戶提供實驗室一站式服務。益元利康已成為多家生物品牌的代理商,如ALZETMedKoo、EZB、WaKoZymo research、Qiagen等,為用戶提供完善的產品、專業的咨詢,助力推動中國生命科學研究快速發展。

荷蘭MRC部分產品目錄:

產品品類

產品名稱

貨號

MLPA探針

SALSA MLPA探針P333 EP300

P333

SALSA MLPA探針P334 Gonadal

P334

SALSA MLPA探針P335 ALL-IKZF1

P335

SALSA MLPA探針P343 Autism-1

P343

MLPA試劑

SALSA MLPA試劑盒- 100 reactions (6 vials) - Cy5

EK1-CY5

SALSA MLPA試劑盒 - 100 reactions (6 vials) - FAM

EK1-FAM

SALSA MLPA試劑盒 - 500 reactions - Cy5

EK5-CY5

SALSA MLPA試劑盒 - 500 reactions - FAM

EK5-FAM

SALSA MLPA試劑盒 - 2000 reactions - FAM

EK20-FAM

DigitalMLPA探針

SALSA digitalMLPA Probemix D001 Hereditary Cancer Panel 1

D001

SALSA digitalMLPA Probemix D006 Multiple Myeloma

D006

SALSA digitalMLPA Probemix D007 Acute Lymphoblastic Leukemia

D007

DigitalMLPA試劑

SALSA digitalMLPA Reagent Kit

DRK01

SALSA digitalMLPA Barcode Plate

BP01

SALSA Ligase Buffer A - 360 µl

SMR12

SALSA Ligase-65 - 115 µl

SMR20

SALSA PCR Primer Mix P5P7 - 240 µl

SMR25

SALSA MLPA Buffer - 180 µl

SMR33

SALSA Ligase Buffer C - 360 µl

SMR37

SALSA Polymerase - 115 µl

SMR55

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