一、 試劑盒概述與原理
產品名稱: E.Z.N.A.® Cycle-Pure Kit
貨號: D6492
用途: 用于快速純化PCR、酶切、標記等反應后的DNA產物,去除引物、引物二聚體、dNTPs、鹽離子、酶等雜質。
原理: 基于 硅膠柱(HiBind® DNA Mini Column) 技術。在高鹽條件下,DNA會特異性地吸附到硅膠膜上,而雜質則被洗脫。隨后在低鹽緩沖液中將純凈的DNA洗脫下來。
特點:
快速: 整個過程可在15-20分鐘內完成。
高效: 對100bp至10kb的DNA片段回收率高。
高純度: 純化后的DNA可直接用于測序、克隆、酶切、連接等下游實驗。
二、 試劑盒組成(以D6492-01為例,100次預裝)
請在使用前核對以下試劑是否齊全且充足:
1. CP Buffer: 結合緩沖液(含高濃度離液鹽)。
2. DNA Wash Buffer(濃縮液): 漂洗液,使用前必須按說明書要求加入無水乙醇進行稀釋(通常是在整瓶中加入指定體積的無水乙醇)。
3. Elution Buffer: 洗脫液(10 mM Tris-HCl, pH 8.5)。也可使用無菌去離子水(pH > 7.0)代替,但用Elution Buffer洗脫效率通常更高。
4. HiBind® DNA Mini Columns: 吸附柱(2 mL)及收集管(2 mL)。
5. 說明書。
三、 標準操作流程
實驗前準備:
將DNA Wash Buffer按說明書要求用無水乙醇稀釋。
將CP Buffer和Elution Buffer置于室溫融化。
準備好無水乙醇。
第一步:平衡結合條件
1. 向您的PCR反應液中加入5倍體積的CP Buffer(例如,50μL PCR產物 + 250μL CP Buffer)。
2. 用移液器充分吹打混勻。
第二步:DNA結合
1. 將混合物全部轉移到HiBind® DNA Mini Column中(柱子裝在2mL收集管內)。
2. 室溫(15-25°C),≥10,000 x g 離心 30-60秒。
3. 棄去收集管中的濾液,將柱子放回同一收集管中。
第三步:漂洗
1. 向柱子中加入 700μL DNA Wash Buffer(已含乙醇!)。
2. 室溫,≥10,000 x g 離心 30-60秒。
3. 棄濾液,將柱子放回收集管。
4. 重復步驟1-3一次(即總共用Wash Buffer漂洗兩次)。
5. 空離以cedi去除殘留乙醇: 將空柱以最大轉速(≥13,000 x g)離心 2分鐘。這一步至關重要,因為殘留的乙醇會嚴重影響下游酶促反應。
第四步:洗脫DNA
1. 將柱子轉移到一個新的、干凈的 1.5mL 離心管中。
2. 向柱子硅膠膜的正中央,懸空滴加 15-30μL Elution Buffer(或無菌水)。
3. 室溫靜置 2-5分鐘,使緩沖液充分浸潤膜。
4. 室溫,≥10,000 x g 離心 1分鐘。離心管底部的液體即為您純化后的DNA。
5. (可選,用于提高得率) 將離心得到的洗脫液重新加回柱子吸附膜中央,再次離心1分鐘。
四、 關鍵要點與經驗總結
1. 比例是關鍵: “PCR產物:CP Buffer = 1:5" 這個比例必須遵守。這是保證DNA高效結合到柱上的前提。如果產物體積很小,可以先用無菌水補足到一定體積(如50μL)再加CP Buffer。
2. 乙醇是必須的: 使用前務必確認 DNA Wash Buffer 已加入正確量的無水乙醇。未加乙醇的Wash Buffer無法有效去除鹽分。
3. cedi去除乙醇: 最后的 “空離2分鐘" 步驟絕對不能省略。殘留的乙醇會抑制后續(xù)的酶(如連接酶、測序酶等)活性。離心后可以打開柱子蓋,在室溫下再放置幾分鐘讓殘余乙醇wanquan揮發(fā)。
4. 提高洗脫效率:
預熱Elution Buffer: 將洗脫液預熱至65°C或更高溫度,可以顯著提高DNA的洗脫效率,從而提高最終得率。
洗脫體積: 洗脫體積越小,濃度越高,但總得率可能會略有下降。根據下游應用需求平衡。對于測序,通常用15-20μL洗脫;對于需要高濃度DNA的應用,可以嘗試用10μL洗脫。
5. 關于DNA片段大小: 該試劑盒適用于100bp - 10kb的片段。對于非常小的片段(如<100bp的引物二聚體),在高鹽條件下結合效率較低,因此可以被有效去除。對于非常大的片段(>10kb),結合和洗脫效率會下降,需酌情增加結合和洗脫時間。
五、 下游應用
純化后的DNA適用于:
Sanger測序
限制性內切酶消化
連接與克隆
體外轉錄/翻譯
下一代測序(NGS)文庫構建等。
六、常見問題排查
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